In Judas keert de Israëlische schrijver Amos Oz terug naar het Jeruzalem van de winter 1959-1960. Student Sjmoeël Asj stopt om financiële redenen aan de universiteit en met zijn studie over Jezus in de ogen van de joden. Hij vindt een baantje in een oud huis in Jeruzalem waar hij met de oude man Wald dagelijks urenlang moet converseren en verder enkele kleinere taken moet vervullen in ruil voor kost en inwoon. In het huis woont ook de ongeveer 45-jarige vrouw Atalja, tot wie hij zich al snel aangetrokken voelt. Maar er hangt een mysterieuze sfeer in het huis, geleidelijk aan ontdekt hij dat zij de schoondochter van Wald is en dat Walds zoon in de oorlog van 1948 op gruwelijke wijze aan zijn einde kwam.